汕头大学医学院目前有三个校区：一个是位于市中心的医学院本部校区，一个位于汕头大学主校区，距离汕头市中心约10公里，另一个位于汕头大学东海岸校区，距离汕头市中心约15公里。临床医学与眼视光医学专业的学生前2-4年先在汕头大学主校区上课，剩余的学年在医学院或医院上课或实习。护理学专业的学生在汕头大学东海岸校区上课。校区之间有定期的校车。

　　在李嘉诚基金会的支持下，汕头大学医学院新医学中心于2016完成并投入使用。新的医学中心以生命科学为中心，通过整合宝贵资源，实现了全方位的多学科整合，是一个独特而创新的学习环境，将人与自然结合在一起，并有助于培养学生和员工的创造力。